Celem zbiornika wodnego Gabčíkovo jest przede wszystkim ochrona przed powodziami, które wielokrotnie powodowały katastrofalne zalania terenów przylegających do Dunaju.
Zbiornik Gabčíkovo umożliwia całoroczną, nieprzerwaną żeglugę na Dunaju oraz dostarcza około 8% rocznego zapotrzebowania na energię elektryczną w Republice Słowackiej.
Zbiornik wodny Gabčíkovo odgrywa bardzo ważną rolę w stabilizacji koryta Dunaju, tworząc warunki do ochrony śródlądowej delty tej rzeki oraz otwierając możliwości dla rozwoju rekreacyjnego całego okolicznego regionu.