Głównym celem zapory wodnej jest ochrona przeciwpowodziowa, potopy w sąsiednich terytoriach Dunaju wielokrotnie spowodowały katastrofalne powodzie.
Następną funkcją jest zapewnianie żeglowania podczas całego roku, dostarczanie energii elektrycznej (w ilości około 8% rocznego zużycia energii Republiki Słowackiej), dodatkowo stabilizuje koryto rzeki Dunaj oraz stworzyła warunki dla ochrony Dunaju i możliwości do rozwoju rekreacji całego okolicznego obszaru.
Zapora wodna Gabczykowo odzwierciedla ludzką zdolność do dostosowania swoich interesów do potrzeb natury. Przypadek ten spełnia wymogi utrzymywalnego rozwoju ekologii.
